食品工程学院始建于1958年，1986年获得食品工程学科硕士学位授予权。1996年，食品科学学科被原国内贸易部确认为部级重点学科，2000年被黑龙江省评定为省级重点学科，同年获得粮食、油脂与植物蛋白工程学科硕士学位授予权。2006年获食品科学二级学科博士学位授予权、食品科学与工程一级学科硕士学位授予权及发酵工程二级学科硕士学位授予权。2010年获得食品工程领域专业硕士学位授予权。2011年食品科学与工程一级学科被评定为省级重点学科。2018年获一级学科博士学位授予权。2022年入选黑龙江省“双一流”二期建设项目中的“国内一流学科”建设序列及黑龙江“省双一流”建设特色学科建设项目。2023年获批食品科学与工程博士后科研流动站。

学院拥有食品科学与工程国家一流本科专业1个，生物工程省一流本科专业1个。学院拥有总建筑面积20000平米的实验教学与科学研究专用大楼，6个省级平台（黑龙江省谷物资源与谷物加工重点实验室1个、黑龙江省普通高校食品科学与工程重点实验室1个、黑龙江省绿色食品贮藏与加工工程省级实验室1个、黑龙江省高校食品化学实验教学示范中心1个、食品工程研究所1个、分析检测中心1个），1个稻米精深加工产业技术研究院、1个东北食药资源开发创新中心、4个中外联合科技研究中心（中乌、中塞、中俄、中波），27个创新创业实践基地和20个校企合作研发中心。

 学院现有教师80人，从事科研工作的教师61人，其中教授28人，副教授26人，获博士学位的教师58人，有新世纪百千万人才工程国家级人选、享受国务津贴的专家、教育部新世纪优秀人才、龙江学者特聘教授、黑龙江省杰出青年基金获得者、省级重点学科带头人、省级领军人才梯队带头人等各级学术称号者28人次。省级教学名师1人，省道德模范1人，省劳动模范1人。博士生导师14人、硕士生导师56人，已形成一支以中青年教师为骨干，年龄结构、学历结构及学缘结构合理，理论基础扎实，科研实践经验丰富，思维活跃，创新意识与团队协作精神较强，在国内本学科领域颇具影响的研发队伍。

近十年累计科研经费总额1.5亿元。其中：国家重点研发计划项目5项，国家自然科学基金17项、中央财政支持地方高校发展专项资金项目4项、省部级项目65项（其中省科技厅重大专项8项），横向课题300项。取得各级奖励18项，其中省科技进步二等奖2项。获国家专利56项，出版著作和教材18部，获得省级优秀教材二等奖2部；发表学术论文3000余篇，其中SCI收录论文600余篇。省级教学成果一等奖2项，省一流课程1门。

学院先后为100余家食品企业提供技术咨询、跟踪式支持、产品开发以及分析检测等服务；为秋林格瓦斯、五常金禾米业全谷物米制品、东方粮油稳定化米糠产品、红菇娘饮料等50余家企业研发的产品均已上市，取得经济效益10亿元，出口创收1千万美金。近十年，参与国家级食品产业、国家和地方发展规划50余项；参与制定行业标准23项；参加黑龙江省多项地方法规、标准的决策咨询30人次；累计开展食品安全培训130180余人次，组织线上食品企业防疫讲座3次，为中国科协拍摄科普宣传片8部，为黑龙江省市场监督管理局开展科普讲座8场次。承办国际、国内学术会议25项。作为黑龙江省食品科学技术学会、黑龙江省发酵工程学会和黑龙江省饮品学会的主管依托单位和佳木斯建三江稻米联盟的秘书长单位，学院始终坚持致力于整合行业资源，服务行业发展。

学院现有全日制在校学生1632人，其中研究生253人，本科学生1379人。建院至今，已为国家和地方经济建设培养了大批管理和专业技术人才，为中国食品行业发展做出了重要贡献。

绿水青山，钟灵毓秀，美丽冰城，寒地粮仓，一代代商大食品人深耕于这片富饶肥沃、历史底蕴厚重的黑土地上，传承着华夏精髓，谱写探索与奋斗并进、光荣与梦想交织的光辉乐章。蕴育英才硕果累累，催化成果不断创新。历经了学科开创期老一代人的艰难困苦、与汝欲成的艰辛，凭借着学科传承者的栉风沐雨、砥砺前行，依靠着新生代的致知力行、继往开来的奋进勇攀、跛行千里，在振兴龙江的事业中发扬食品人的锐意进取、功勋卓著。食品工程学院将持续秉承民以食为天、研食善思，师以生为本、怀德勉行的理念，开展教书育人和科技创新工作，在人才培养、科学研究、社会服务、文化传承创新、国际合作交流方面励志实干，为学校事业高质量发展做出新的更大贡献。